Michael Cia è cresciuto nel settore giovanile dell'FCS ed è apparso subito chiaro il potenziale di questo centrocampista vivace e tecnicamente abile. Le convocazioni nelle nazionali giovanili e gli applausi sugli spalti alle sue partite non sono stati da meno e l'Atalanta, società di Serie A, ha acquisito i diritti di trasferimento del centrocampista a soli 19 anni. Prima di allora, Cia ha esordito rapidamente con i professionisti dell'FCS, diventando il più giovane marcatore della storia del club. L'Atalanta ha mandato il biondo alla Sambenedettese in serie C1, dove è diventato un eroe grazie a cinque reti importanti. L'anno successivo passa in Serie B con Triestina (24 presenze e 2 gol) e Albinoleffe (2 anni e 26 presenze).
Nella stagione 2011/12, Michael ha raggiunto il suo apice, misurato in gol. Ha segnato 11 gol in 32 partite per il Benevento in Serie C1. Negli anni successivi, Cia ha giocato nel Como (23 presenze - 3 gol) e nel Pisa (21 partite - 1 gol) prima di tornare in Alto Adige.